Rūpnīcas kuģis, ko sākotnēji sauca arī par mātes kuģi, bija liels kuģis, ko izmanto vaļu medībās, bet tagad, plašāk runājot, jebkurš kuģis, kas ir aprīkots, lai apstrādātu jūras nozveju dažādiem patērētājiem. Tas parasti kalpo kā galvenais kuģis flotē, kas tiek nosūtīta uz ūdeņiem tālu no mājas ostas, lai nozvejotu, sagatavotu un uzglabātu zivis vai vaļus tirdzniecībai.
Komerciālā zveja: Rūpnīcas vai apstrādes traleri
Tie ir lielākie zvejas kuģu tipi. Pēc nozvejas un šķirošanas zivis pārvieto uz apstrādes klāju, kur tās apstrādā
Mūsdienu rūpnīcas kuģis ir automatizēta, ievērojami palielināta agrīnā vaļu versija, kas kuģoja attālos ūdeņos un uz kuģa apstrādāja tikai vaļu eļļu, izmetot liemeni. Mūsdienīgāki kuģi visu vaļu pārveidoja par izmantojamiem izstrādājumiem. Šo kuģu efektivitāte un arvien efektīvākās vaļu medībās izmantotās metodes draudēja vairāku vaļu sugu izzušanai un radīja vajadzību pēc moratorijiem lielāko daļu sugu medībām. Tas noveda pie krasa samazinājuma rūpnīcu kuģu izmantošanā vaļu medībām, taču to izmantošana zvejniecībā ir dramatiski pieaugusi. Tādās valstīs kā Krievija un Japāna tiek uzturētas plašas zvejas flotes, kuru centrā ir rūpnīcu kuģi.