Japāņu pareizticīgo baznīca, Austrumu pareizticīgo baznīcas autonoma institūcija, kanoniskā saistībā ar Maskavas patriarhātu, kas apstiprina Tokijas metropoles ievēlēšanu. Japānas pareizticīgo baznīca tika izveidota ar izcilā misionāra Nikolaja Kasatkina (1836–1912) pūlēm, kurš kļuva par pirmo Japānas pareizticīgo arhibīskapu un 1970. gadā tika kanonizēts par svēto.
Kopš misijas sākuma (1872. gadā) baznīca nekad nebija atkarīga no ārvalstu misionāru personāla. Japāņu priesteri tiek ordinēti pēc apmācības seminārā Tokijā, un garīdznieku un laicīgo sapulce pilnībā kontrolē baznīcas lietas. Šis japāņu pareizticības pamatiedzīvotāju raksturs ļāva tai izdzīvot vairākos politiskos pārbaudījumos un izolācijas periodos, piemēram, Krievijas-Japānas karā un divos pasaules karos. Laika posmā no 1945. līdz 1970. gadam baznīca atradās Krievijas Amerikas metropolitāna baznīcā. 1970. gadā tā saņēma pastāvīgu autonomu statūtu no Maskavas patriarhāta, tās mātes baznīcas. Tokijas pareizticīgo katedrāle, ko tā dibinātājam Nikolajam Kasatkinam dēvē par Nikolaja katedrāli, ir viena no lielākajām reliģiskajām celtnēm Japānas galvaspilsētā. Baznīcai, kurā ir apmēram 30 000 locekļu, ir diecēzes Tokijā, Kyōto un Sendai.
