Ir divi Slovēnijas valsts karoga balti-zili-sarkanās krāsas avoti. Napoleona karu laikā Slovēnija sava nacionālā etniskā karoga reklāmai bija pieņēmusi Krievijas karoga kopiju, lai parādītu solidaritāti ar citām slāvu tautām. Tomēr vēl agrāk Svētās Romas imperators bija piešķīris ģerboni “Carniola kroņa zemei”, kas toreiz bija impērijas sastāvdaļa. Uz šī ģerboņa tika attēlots balts vairogs, uz kura bija zils ērglis ar sarkanā un baltā rūtainu pusmēness krūtīs. Vēl viens nozīmīgs ģerbonis Slovēnijas vēsturē bija Celjes apgabala izmantotais ģerbonis - zils vairogs ar trim dzeltenām zvaigznēm. Visbeidzot, 20. gadsimta komunistiskajā režīmā Slovēnijas ģerbonim bija zilas un baltas viļņotas horizontālas līnijas, kas liecināja par valsts Adrijas jūras piekrasti, kā arī stilizēts trīs virsotņu kalns - Slovēnijas augstākais, slavenais Triglavs.
Slovēnija pasludināja savu neatkarību 1991. gada 25. jūnijā, taču, lai nodibinātu savu suverenitāti, bija jācīnās pret Dienvidslāvijas armiju. Karogs, kas tika pacelts Neatkarības dienā, bija tradicionālais balts-zili-sarkans pan-slāvu trīskrāsains. Lai to atšķirtu no līdzīgiem Krievijas un Slovākijas karogiem, pacēlāja augšējā stūrī tika pievienots jaunais Slovēnijas ģerbonis, kas pārklājās ar baltajām un zilajām svītrām. Šajā vairogā ir Triglava un komunistisko ieroču viļņotu svītru kombinācija ar dzeltenām zvaigznēm uz zila fona no Celje vairoga.
