Kolonija zooloģijā ir vienas sugas organismu grupa, kas dzīvo un cieši mijiedarbojas viens ar otru. Kolonija atšķiras no agregācijas, kas ir grupa, kuras locekļiem nav mijiedarbības. Mazi, funkcionāli specializēti, piesaistīti organismi, ko cnidarianos sauc par polipiem un bryozoans zooīdiem, veido kolonijas, un tos var pārveidot, lai sagūstītu laupījumu, pabarotu vai pavairotu. Sociālo kukaiņu kolonijās (piemēram, skudras, bites) parasti ietilpst kastas ar dažādiem pienākumiem.
termīts: koloniju veidošanās un attīstība
Jaunu termītu koloniju parasti dibina spārnoto pieaugušo cilvēku izkliede (no), kas parasti attīstās nobriedušā kolonijā noteiktu laiku
Pagaidu vaislas kolonijas veido daudzi putni. Dažiem putniem var būt nepieciešama daudzu veidu klātbūtne, lai stimulētu reproduktīvās darbības. Citi (piemēram, kaijas) vaislas kolonijās ir ierobežota vairošanās biotopa dēļ un koordinē savus centienus ligzdu aizsardzībā no plēsējiem.
